2012年尽管被认为有可能成为大数据应用的一个里程碑，事实上对于许多机构来说该领域也存在很大的挑战。英国BAE系统公司的信息情报专家分析了公共部门在大数据时代早期所面临的5个关键问题，并提出相应建议。

（1）机构将需要对利用新的数据类型所产生的不同结果形成一个明确的规划。最初，公共部门关注的重点包括在线服务的设计、反诈骗和网络安全。在获得高回报前往往需要进行一些前期试验，犯一些错误。在大数据利用的第一次浪潮后也出现了一些负面新闻。对于这些，机构都应有所准备。

（2）大数据将需要强大的数据管理方法。在大数据时代的早期阶段，一些组织采用了“全存储”的方法，以期最终证明数据的价值。由于公共部门信息技术的巨大成本压力，势必造成有关大数据利用的可行性和成本的问题。组织一旦获取数据后，将面临如何使大数据变小，如何通过对输入数据流的智能过滤以及严格的数据保留和管理政策来捕获和存储有价值的信息而非蓄积大量原始数据的挑战。

（3）数据隐私问题将会对“大数据”产生越来越大的影响。这些数据的处理和应用的目的将会受到越来越多的公共监督。同时数据隐私也仍是欧盟数据保护法规通过协商进程提出的一个关键问题。

（4）关注大数据的安全性。大数据领域的重点已转向克服数据流捕获、存储和处理的技术挑战。但对其安全性缺乏重视。由于一些大数据源的潜在价值，黑客和其他恶意人群向大数据发起攻击只是一个时间问题。

（5）从技术的角度来看，大数据时代是大量新工具和创新公司涌现的阶段。供应商要形成无缝适应现有企业IT构架的成熟产品结构还需要一段时间。由于许多公共机构负责运行或支持关键的国家基础设施，这些机构IT设备需要保持稳定，因此应约束其快速采用商界研发的新技术。这将限制大数据在一些领域应用的速度。