2018年10月15日《自然-生物技术》报道，美国威尔康奈尔医学院研究人员发明了一种技术，可以发现组织样本中相同基因在不同细胞中的不同表达，使研究者能够更好地理解体内不同细胞类型的独特分子运作，促进对由异常基因活性引起的疾病的理解。 

　　基因的核心功能是存储制造蛋白质的代码。当基因在细胞中处于活跃状态，酶会反复将其复制成转录本RNA，进一步加工成mRNA，再翻译成特定蛋白质。然而，相同基因并不总是产生相同的mRNA。根据细胞的具体情况或细胞类型，基因的转录本RNA可能被加工、切割并转译成不同的mRNA亚型，这些亚型反过来又编码不同的蛋白质。体内数百种不同的细胞类型不仅在活跃的基因模式上存在差异，而且在这些基因产生的特定mRNA亚型也存在差异。然而，目前还没有用于区分在不同细胞类型中产生的不同mRNA亚型的有效技术，尤其是当细胞样本是一个包含多种混合细胞类型的大块组织样本时。 

　　在这项新技术中，大样本中的每一个细胞被困在微小的液体液滴中，每个细胞的mRNA被转化为更稳定的DNA分子，然后用独特的DNA标记物（条形码）来标记该细胞。这些数万个转化后的mRNA可以使用短读和长读技术进行测序。短读测序数据提供了基因活动的全貌，并识别细胞类型，例如神经元或免疫细胞。长读测序数据揭示了细胞中每个活性基因产生的特定mRNA亚型。条形码将这些mRNA序列数据与个体细胞联系起来。 

　　使用这种被称为单细胞亚型RNA测序（Single-cell ISOform RNA-Sequencing，ScISOr-Seq）技术，科学家们能够从大约6000个细胞组成的小鼠脑组织样本中提取细胞，根据其基因活动模式将细胞分为不同的细胞类型，然后识别每种细胞类型中产生的不同mRNA亚型。该实验结果首次揭示了从未描述过的老鼠大脑细胞的成千上万个mRNA亚型。 

　　研究者计划将基于ScISOr-Seq的研究扩展到更多的组织和细胞类型。他们还打算使用该技术比较患病细胞与健康细胞中的mRNA亚型。异常的mRNA亚型越来越被认为是疾病的原因，包括一些癌症。 

    吴晓燕 编译自https：//phys.org/news/2018-12-genes.html 

　　原文链接：https://www.nature.com/articles/nbt.4259 

    原文标题：Single-cell isoform RNA sequencing characterizes isoforms in thousands of cerebellar cells