2018年6月13日，美国加州大学伯克利分校研究人员《自然》期刊上的论文称他们美国研究团队重新构建了数百个非培养和未被研究过的微生物近乎完整的基因组草图，并鉴定了一千多个生物合成基因簇，或为新型抗生素和其他药用化合物开发提供来源。 

　　在土壤生态系统中，微生物产生多种次生代谢物，如抗生素、抗真菌剂以及介导与其他生物和环境交流、竞争和相互作用的铁载体。目前大多数已知的抗生素来自少数几种可培养的微生物类群，并且很少有研究关注土壤中其他大部分细菌的生物合成潜力。该研究团队研究了来自草原土壤宏基因组，并鉴定了先前未研究过的微生物门中的菌株，它们含有编码多种聚酮化合物和非核糖体肽生物合成的基因簇，这些基因簇与以往充分研究的基因簇有所不同。这些生物合成基因座由酸杆菌门、疣微菌门和芽单胞菌门以及候选门Rokubacteria中新鉴定的成员所编码，这些细菌在土壤中非常丰富，但此前没有报道将基因组信息与次生代谢产物联系起来。这些基因的表达因土壤样品采集的深度和位置而有所不同，反映了它们对不同环境条件的生物反应。