2017年7月31日，纽约基因组研究中心（NYGC）研究人员在《自然方法》发表论文称，研究开发了一种新型基因组工具CITE-seq，能帮助推动单细胞RNA测序的进程，深入解读单细胞的特性，有效区分不同的细胞类型，以及研究多种人类疾病的发病机制。 

　　CITE-seq（Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by sequencing）能够对数千个单细胞的表面蛋白标记物进行测定，同时对相同单细胞中的信使RNA进行测序。研究人员正在对该技术进行概念验证研究，他们结合转录组学技术，对8000个单细胞表面的10种表面蛋白进行了监测，这是目前为止对单细胞进行的最大规模的多维度分析。 

　　CITE-seq技术能够检测蛋白质组分，基于DNA条形码抗体产生排序的读数，同时捕获细胞转录组学信息，而该技术所产生的蛋白质和RNA数据的整合则需要定制化数据分析。研究者举例说，仅利用转录组学研究很难对自然杀伤细胞的亚群进行区分，而CITE-seq技术可以利用多通道数据来鉴别自然杀伤细胞亚群。 

　　CITE-seq技术能够精细化分析细胞群体的能力将会使其在研究领域具有很多的应用价值，例如肿瘤样本可以利用CITE-seq技术来检测单一肿瘤细胞以及浸润肿瘤组织的多种不同的免疫细胞池；这项新技术还能用于对肿瘤异质性的深度特性分析，推动免疫治疗领域的进展。