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欧洲研发生物成像开源软件

在德国和芬兰研究人员的努力下,一种新的开源软件已开发成功。它可使现有多维生物成像、处理和分析过程变得更加简便易行。这种名为BioImageXD的软件可使得诸如分子向细胞表面移动和两者相结合等细胞和组织分析过程得以简化。该研究成果发表在最新一期的“Nature Methods”杂志上。该项研究获得了欧盟第七框架项目的资助。

该软件可用于细胞表面构成分析,它还具有探测癌细胞在三维环境中的扩散状况,并可用于鉴定病毒和耙向药物进入细胞的有效性,实现这些前所未有的功能。BioImageXD软件的特点是可以辅助研究人员构建全新的分析方法,同时处理海量的图像信息和分析数以百万计的分子。据该研究团队称,对比实验结果表明BioImageXD比其他类似程序运算速度更快,也更为灵敏。

由Jyrki Heino领导的芬兰于韦斯屈莱大学研究团队在10年前开始了BioImageXD软件的开发。研究人员在此期间合作完成了软件的设计和优化。主要的开发工作由原任职于图尔库生物技术中心的细胞成像核心协调员Pasi Kankaanpää领导。该项目还获得了芬兰科学院和芬兰技术创新基金会的资助。

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